يعتمد بناء التصميم في الأساس على رمز لمدينة جدة الساحلية، حيث تم تصميم القارب يحمل أشرعة تحمل اسم الجامعة والمدينة التي تحتضنها (جدة). ويعلو اللوجو رمز لإشراق شمس المعرفة على المملكة، وعلى العالم أجمع عن طريق الجامعة التي تعمل كميناء لاستيراد وتصدير العلوم والثقافة والفنون، وهو ما يظهر أسفل اسم الجامعة ممثلا في القلم والكتاب.
